Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CUL1Q13616 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL1Q13616 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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