Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PEX6Q13608 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PEX6Q13608 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PEX6Q13608 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PEX6Q13608 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PEX6Q13608 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PEX6Q13608 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PEX6Q13608 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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PEX6Q13608 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
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