Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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