Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMED1Q13445 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
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TMED1Q13445 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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TMED1Q13445 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED1Q13445 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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