Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
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