Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATMQ13315 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATMQ13315 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATMQ13315 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATMQ13315 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATMQ13315 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ATMQ13315 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATMQ13315 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATMQ13315 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATMQ13315 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATMQ13315 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATMQ13315 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATMQ13315 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATMQ13315 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATMQ13315 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATMQ13315 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATMQ13315 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATMQ13315 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATMQ13315 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATMQ13315 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATMQ13315 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATMQ13315 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATMQ13315 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ATMQ13315 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATMQ13315 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATMQ13315 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATMQ13315 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATMQ13315 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATMQ13315 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATMQ13315 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATMQ13315 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATMQ13315 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATMQ13315 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATMQ13315 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATMQ13315 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATMQ13315 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATMQ13315 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATMQ13315 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATMQ13315 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATMQ13315 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATMQ13315 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATMQ13315 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATMQ13315 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATMQ13315 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATMQ13315 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATMQ13315 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATMQ13315 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATMQ13315 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATMQ13315 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATMQ13315 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATMQ13315 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATMQ13315 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATMQ13315 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATMQ13315 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATMQ13315 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATMQ13315 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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