Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3FQ13275 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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