Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MKRN3Q13064 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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