Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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