Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFIAQ12857 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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