Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB40BQ12829 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms