Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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