Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms