Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 OPI6YDL096C 327 nt5.41□□□□□ -1.54
BUD20Q08004 SUR2YDR297W 1050 nt5.41□□□□□ -1.54
BUD20Q08004 GPI14YJR013W 1212 nt5.41□□□□□ -1.54
BUD20Q08004 IST1YNL265C 897 nt5.41□□□□□ -1.54
BUD20Q08004 PEX30YLR324W 1572 nt5.41□□□□□ -1.54
BUD20Q08004 MNN1YER001W 2289 nt5.4□□□□□ -1.54
BUD20Q08004 YFL034WYFL034W 3222 nt5.4□□□□□ -1.54
BUD20Q08004 YKE2YLR200W 345 nt5.4□□□□□ -1.54
BUD20Q08004 YLR428CYLR428C 345 nt5.4□□□□□ -1.54
BUD20Q08004 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt5.4□□□□□ -1.54
BUD20Q08004 TRF5YNL299W 1929 nt5.4□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 MNT4YNR059W 1743 nt5.4□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 PPR1YLR014C 2715 nt5.39□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 YND1YER005W 1893 nt5.39□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 RAT1YOR048C 3021 nt5.39□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 TIF35YDR429C 825 nt5.39□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 YER088C-AYER088C-A 324 nt5.39□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 YFL015CYFL015C 495 nt5.39□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 HOR7YMR251W-A 180 nt5.39□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 CTM1YHR109W 1758 nt5.39□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 IMD4YML056C 1575 nt5.38□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 NUD1YOR373W 2556 nt5.38□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 TRP5YGL026C 2124 nt5.38□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 GSY2YLR258W 2118 nt5.38□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 DSL1YNL258C 2265 nt5.38□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 APP1YNL094W 1764 nt5.38□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 YDL228CYDL228C 642 nt5.38□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 SLX8YER116C 825 nt5.38□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 YHL026CYHL026C 948 nt5.38□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 YAR070CYAR070C 300 nt5.38□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 YPL142CYPL142C 318 nt5.38□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 YOR022CYOR022C 2148 nt5.38□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 RPC11YDR045C 333 nt5.37□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 NOP19YGR251W 591 nt5.37□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 CNB1YKL190W 528 nt5.37□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 RPL15AYLR029C 615 nt5.37□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 YLR076CYLR076C 423 nt5.37□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 IRC23YOR044W 474 nt5.37□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 SCY1YGL083W 2415 nt5.37□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 SPC19YDR201W 498 nt5.36□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 NIT2YJL126W 924 nt5.36□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 TMC1YOR052C 453 nt5.36□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 HXT14YNL318C 1623 nt5.36□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 PCK1YKR097W 1650 nt5.36□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 VPS45YGL095C 1734 nt5.36□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 GSM1YJL103C 1857 nt5.36□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 NDC80YIL144W 2076 nt5.36□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 VPS70YJR126C 2436 nt5.35□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 PRP28YDR243C 1767 nt5.35□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 MFA1YDR461W 111 nt5.35□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 HSK3YKL138C-A 210 nt5.35□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 YKL223WYKL223W 333 nt5.35□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 RDN58-1RDN58-1 158 nt5.35□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 RDN58-2RDN58-2 158 nt5.35□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 HHF2YNL030W 312 nt5.35□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 ATX1YNL259C 222 nt5.35□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 RSC30YHR056C 2652 nt5.35□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 SNT2YGL131C 4212 nt5.35□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 YTA12YMR089C 2478 nt5.35□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 VIK1YPL253C 1944 nt5.35□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 HPF1YOL155C 2904 nt5.34□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 HSP104YLL026W 2727 nt5.34□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 OSW7YFR039C 1533 nt5.34□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt5.34□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 RPL26AYLR344W 384 nt5.34□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 REI1YBR267W 1182 nt5.34□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 CRZ1YNL027W 2037 nt5.34□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 RAD61YDR014W 1944 nt5.34□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 TPD3YAL016W 1908 nt5.34□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 RIM101YHL027W 1878 nt5.34□□□□□ -1.55
BUD20Q08004 DBF20YPR111W 1695 nt5.34□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 RSC6YCR052W 1452 nt5.33□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 YDR053WYDR053W 396 nt5.33□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 IRC4YDR540C 540 nt5.33□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt5.33□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt5.33□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 RPS7BYNL096C 573 nt5.33□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 MCM6YGL201C 3054 nt5.33□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 SSZ1YHR064C 1617 nt5.33□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 YRR1YOR162C 2433 nt5.33□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 PHO8YDR481C 1701 nt5.32□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 RPL34AYER056C-A 366 nt5.32□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 YGL052WYGL052W 306 nt5.32□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 RPS4BYHR203C 786 nt5.32□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 RPL34BYIL052C 366 nt5.32□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 SYP1YCR030C 2613 nt5.32□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 SAC1YKL212W 1872 nt5.32□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 UTP13YLR222C 2454 nt5.32□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 POL12YBL035C 2118 nt5.32□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 UTR4YEL038W 684 nt5.31□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 MIC19YFR011C 513 nt5.31□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 YFR054CYFR054C 579 nt5.31□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 SCW4YGR279C 1161 nt5.31□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt5.31□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 YAR068WYAR068W 486 nt5.31□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 SIP18YMR175W 240 nt5.31□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 URA10YMR271C 684 nt5.31□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 snR13snR13 124 nt5.31□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 MVP1YMR004W 1536 nt5.31□□□□□ -1.56
BUD20Q08004 DSF2YBR007C 2211 nt5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.3 ms