Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNK2Q07912 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms