Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLEQ07864 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLEQ07864 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLEQ07864 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLEQ07864 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLEQ07864 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLEQ07864 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLEQ07864 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLEQ07864 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLEQ07864 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLEQ07864 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLEQ07864 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLEQ07864 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLEQ07864 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLEQ07864 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLEQ07864 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLEQ07864 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLEQ07864 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLEQ07864 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLEQ07864 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLEQ07864 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLEQ07864 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLEQ07864 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLEQ07864 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLEQ07864 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLEQ07864 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLEQ07864 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLEQ07864 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLEQ07864 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLEQ07864 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLEQ07864 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLEQ07864 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLEQ07864 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLEQ07864 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLEQ07864 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLEQ07864 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLEQ07864 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLEQ07864 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLEQ07864 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLEQ07864 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLEQ07864 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLEQ07864 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLEQ07864 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLEQ07864 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLEQ07864 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLEQ07864 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLEQ07864 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLEQ07864 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLEQ07864 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLEQ07864 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLEQ07864 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLEQ07864 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLEQ07864 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLEQ07864 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLEQ07864 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
POLEQ07864 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLEQ07864 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLEQ07864 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
POLEQ07864 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLEQ07864 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLEQ07864 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLEQ07864 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms