Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL18Q07020 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL18Q07020 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL18Q07020 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL18Q07020 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL18Q07020 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL18Q07020 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL18Q07020 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL18Q07020 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL18Q07020 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL18Q07020 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL18Q07020 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms