Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBQ06643 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBQ06643 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBQ06643 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBQ06643 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBQ06643 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LTBQ06643 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LTBQ06643 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBQ06643 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBQ06643 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBQ06643 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBQ06643 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBQ06643 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBQ06643 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBQ06643 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBQ06643 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBQ06643 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBQ06643 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBQ06643 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBQ06643 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBQ06643 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBQ06643 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBQ06643 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBQ06643 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBQ06643 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBQ06643 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBQ06643 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBQ06643 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBQ06643 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBQ06643 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBQ06643 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBQ06643 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBQ06643 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBQ06643 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBQ06643 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBQ06643 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms