Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GABPB1Q06547 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms