Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms