Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms