Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TAP1Q03518 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAP1Q03518 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms