Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAX2Q02962 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms