Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NHLH2Q02577 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms