Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DHODHQ02127 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms