Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTRA4P83105 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms