Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUCB2P80303 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms