Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL20P78556 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL20P78556 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL20P78556 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL20P78556 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL20P78556 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL20P78556 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL20P78556 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL20P78556 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL20P78556 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL20P78556 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL20P78556 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL20P78556 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL20P78556 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCL20P78556 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCL20P78556 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCL20P78556 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL20P78556 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL20P78556 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms