Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms