Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERVK_113P63132 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms