Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL11P62913 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL11P62913 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL11P62913 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL11P62913 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL11P62913 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL11P62913 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL11P62913 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL11P62913 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL11P62913 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL11P62913 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL11P62913 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL11P62913 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms