Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOBP62745 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOBP62745 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOBP62745 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms