Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms