Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
EEFSECP57772 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms