Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB25P57735 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB25P57735 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB25P57735 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB25P57735 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB25P57735 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB25P57735 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB25P57735 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB25P57735 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB25P57735 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB25P57735 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB25P57735 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB25P57735 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB25P57735 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB25P57735 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB25P57735 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB25P57735 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB25P57735 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB25P57735 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB25P57735 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB25P57735 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms