Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBASH3AP57075 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms