Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP1P56182 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP1P56182 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP1P56182 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP1P56182 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP1P56182 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP1P56182 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP1P56182 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP1P56182 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP1P56182 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP1P56182 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP1P56182 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP1P56182 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP1P56182 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP1P56182 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP1P56182 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP1P56182 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP1P56182 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP1P56182 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP1P56182 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP1P56182 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRP1P56182 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP1P56182 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP1P56182 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP1P56182 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP1P56182 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP1P56182 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP1P56182 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP1P56182 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP1P56182 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP1P56182 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP1P56182 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP1P56182 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP1P56182 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP1P56182 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP1P56182 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP1P56182 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP1P56182 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP1P56182 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP1P56182 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP1P56182 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP1P56182 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP1P56182 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP1P56182 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP1P56182 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP1P56182 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP1P56182 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP1P56182 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRP1P56182 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRP1P56182 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRP1P56182 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRP1P56182 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRP1P56182 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRP1P56182 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP1P56182 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP1P56182 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP1P56182 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP1P56182 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP1P56182 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP1P56182 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP1P56182 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP1P56182 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP1P56182 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP1P56182 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP1P56182 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1P56182 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1P56182 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1P56182 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1P56182 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1P56182 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1P56182 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1P56182 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1P56182 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1P56182 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP1P56182 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP1P56182 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP1P56182 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP1P56182 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP1P56182 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP1P56182 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP1P56182 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP1P56182 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP1P56182 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP1P56182 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP1P56182 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP1P56182 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP1P56182 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1P56182 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1P56182 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1P56182 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1P56182 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1P56182 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1P56182 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1P56182 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1P56182 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1P56182 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1P56182 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1P56182 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1P56182 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1P56182 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms