Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF1P55201 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms