Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AFDNP55196 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AFDNP55196 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AFDNP55196 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AFDNP55196 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AFDNP55196 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AFDNP55196 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AFDNP55196 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AFDNP55196 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AFDNP55196 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AFDNP55196 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AFDNP55196 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
AFDNP55196 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AFDNP55196 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
AFDNP55196 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
AFDNP55196 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
AFDNP55196 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFDNP55196 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFDNP55196 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFDNP55196 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFDNP55196 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFDNP55196 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFDNP55196 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFDNP55196 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFDNP55196 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFDNP55196 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFDNP55196 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFDNP55196 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFDNP55196 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFDNP55196 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFDNP55196 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFDNP55196 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFDNP55196 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFDNP55196 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFDNP55196 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AFDNP55196 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AFDNP55196 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
AFDNP55196 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AFDNP55196 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AFDNP55196 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AFDNP55196 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AFDNP55196 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AFDNP55196 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AFDNP55196 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AFDNP55196 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AFDNP55196 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFDNP55196 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFDNP55196 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFDNP55196 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFDNP55196 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
AFDNP55196 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFDNP55196 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFDNP55196 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFDNP55196 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFDNP55196 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFDNP55196 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
AFDNP55196 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFDNP55196 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFDNP55196 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFDNP55196 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFDNP55196 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFDNP55196 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFDNP55196 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFDNP55196 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFDNP55196 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
AFDNP55196 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFDNP55196 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFDNP55196 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
AFDNP55196 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
AFDNP55196 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFDNP55196 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFDNP55196 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
AFDNP55196 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
AFDNP55196 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFDNP55196 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFDNP55196 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFDNP55196 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFDNP55196 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFDNP55196 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFDNP55196 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFDNP55196 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFDNP55196 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFDNP55196 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFDNP55196 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFDNP55196 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
AFDNP55196 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFDNP55196 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
AFDNP55196 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFDNP55196 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFDNP55196 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFDNP55196 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFDNP55196 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFDNP55196 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFDNP55196 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFDNP55196 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFDNP55196 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFDNP55196 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFDNP55196 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFDNP55196 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFDNP55196 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms