Protein–RNA interactions for Protein: P55000

SLURP1, Secreted Ly-6/uPAR-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLURP1P55000 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLURP1P55000 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLURP1P55000 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms