Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GYS2P54840 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GYS2P54840 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GYS2P54840 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GYS2P54840 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GYS2P54840 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GYS2P54840 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GYS2P54840 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GYS2P54840 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GYS2P54840 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GYS2P54840 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GYS2P54840 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GYS2P54840 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GYS2P54840 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GYS2P54840 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GYS2P54840 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GYS2P54840 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GYS2P54840 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GYS2P54840 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GYS2P54840 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GYS2P54840 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GYS2P54840 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GYS2P54840 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GYS2P54840 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GYS2P54840 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GYS2P54840 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GYS2P54840 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GYS2P54840 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GYS2P54840 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GYS2P54840 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GYS2P54840 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GYS2P54840 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GYS2P54840 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GYS2P54840 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GYS2P54840 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GYS2P54840 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GYS2P54840 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GYS2P54840 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GYS2P54840 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GYS2P54840 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GYS2P54840 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GYS2P54840 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GYS2P54840 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GYS2P54840 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYS2P54840 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYS2P54840 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYS2P54840 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYS2P54840 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYS2P54840 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYS2P54840 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYS2P54840 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GYS2P54840 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GYS2P54840 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GYS2P54840 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GYS2P54840 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GYS2P54840 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GYS2P54840 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GYS2P54840 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms