Protein–RNA interactions for Protein: P53127

SNT2, E3 ubiquitin-protein ligase SNT2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNT2P53127 VPS16YPL045W 2397 nt2.4□□□□□ -2.03
SNT2P53127 BNI1YNL271C 5862 nt2.39□□□□□ -2.03
SNT2P53127 SLX9YGR081C 633 nt2.39□□□□□ -2.03
SNT2P53127 PDP3YLR455W 915 nt2.39□□□□□ -2.03
SNT2P53127 YOR146WYOR146W 306 nt2.39□□□□□ -2.03
SNT2P53127 DAD3YBR233W-A 285 nt2.39□□□□□ -2.03
SNT2P53127 TRA1YHR099W 11235 nt2.38□□□□□ -2.03
SNT2P53127 NOP14YDL148C 2433 nt2.38□□□□□ -2.03
SNT2P53127 TCM62YBR044C 1719 nt2.37□□□□□ -2.03
SNT2P53127 YPR177CYPR177C 372 nt2.37□□□□□ -2.03
SNT2P53127 MGA2YIR033W 3342 nt2.37□□□□□ -2.03
SNT2P53127 DIA2YOR080W 2199 nt2.37□□□□□ -2.03
SNT2P53127 IRA1YBR140C 9279 nt2.37□□□□□ -2.03
SNT2P53127 YBT1YLL048C 4986 nt2.37□□□□□ -2.03
SNT2P53127 MSH5YDL154W 2706 nt2.37□□□□□ -2.03
SNT2P53127 MTL1YGR023W 1656 nt2.36□□□□□ -2.03
SNT2P53127 PSY3YLR376C 729 nt2.36□□□□□ -2.03
SNT2P53127 LRE1YCL051W 1752 nt2.36□□□□□ -2.03
SNT2P53127 MED1YPR070W 1701 nt2.35□□□□□ -2.03
SNT2P53127 UPS2YLR168C 693 nt2.35□□□□□ -2.03
SNT2P53127 INP1YMR204C 1263 nt2.35□□□□□ -2.03
SNT2P53127 CTF13YMR094W 1437 nt2.35□□□□□ -2.03
SNT2P53127 CAB2YIL083C 1098 nt2.34□□□□□ -2.03
SNT2P53127 YML094C-AYML094C-A 402 nt2.34□□□□□ -2.03
SNT2P53127 YPL073CYPL073C 486 nt2.34□□□□□ -2.03
SNT2P53127 SWD3YBR175W 948 nt2.34□□□□□ -2.03
SNT2P53127 RTT102YGR275W 474 nt2.34□□□□□ -2.04
SNT2P53127 YIR014WYIR014W 729 nt2.34□□□□□ -2.04
SNT2P53127 AIM23YJL131C 1071 nt2.34□□□□□ -2.04
SNT2P53127 PFD1YJL179W 330 nt2.34□□□□□ -2.04
SNT2P53127 CMR3YPR013C 954 nt2.34□□□□□ -2.04
SNT2P53127 RNY1YPL123C 1305 nt2.33□□□□□ -2.04
SNT2P53127 CTM1YHR109W 1758 nt2.33□□□□□ -2.04
SNT2P53127 DBP5YOR046C 1449 nt2.33□□□□□ -2.04
SNT2P53127 KXD1YGL079W 657 nt2.33□□□□□ -2.04
SNT2P53127 YLR462WYLR462W 609 nt2.33□□□□□ -2.04
SNT2P53127 SOK2YMR016C 2358 nt2.32□□□□□ -2.04
SNT2P53127 MED2YDL005C 1296 nt2.32□□□□□ -2.04
SNT2P53127 YLR124WYLR124W 345 nt2.32□□□□□ -2.04
SNT2P53127 YOR097CYOR097C 528 nt2.32□□□□□ -2.04
SNT2P53127 YJL070CYJL070C 2667 nt2.32□□□□□ -2.04
SNT2P53127 SWA2YDR320C 2007 nt2.32□□□□□ -2.04
SNT2P53127 RLI1YDR091C 1827 nt2.31□□□□□ -2.04
SNT2P53127 SPH1YLR313C 1593 nt2.31□□□□□ -2.04
SNT2P53127 YJL028WYJL028W 336 nt2.31□□□□□ -2.04
SNT2P53127 VPS71YML041C 843 nt2.31□□□□□ -2.04
SNT2P53127 YNL109WYNL109W 546 nt2.31□□□□□ -2.04
SNT2P53127 PSD2YGR170W 3417 nt2.31□□□□□ -2.04
SNT2P53127 CLU1YMR012W 3834 nt2.31□□□□□ -2.04
SNT2P53127 PRP18YGR006W 756 nt2.3□□□□□ -2.04
SNT2P53127 CLC1YGR167W 702 nt2.3□□□□□ -2.04
SNT2P53127 RPS29AYLR388W 171 nt2.3□□□□□ -2.04
SNT2P53127 YCK2YNL154C 1641 nt2.3□□□□□ -2.04
SNT2P53127 MRP10YDL045W-A 288 nt2.29□□□□□ -2.04
SNT2P53127 CWC24YLR323C 780 nt2.29□□□□□ -2.04
SNT2P53127 CSH1YBR161W 1131 nt2.29□□□□□ -2.04
SNT2P53127 UBP3YER151C 2739 nt2.29□□□□□ -2.04
SNT2P53127 SPB4YFL002C 1821 nt2.29□□□□□ -2.04
SNT2P53127 MCD1YDL003W 1701 nt2.28□□□□□ -2.04
SNT2P53127 BUD30YDL151C 582 nt2.28□□□□□ -2.04
SNT2P53127 YIR043CYIR043C 693 nt2.28□□□□□ -2.04
SNT2P53127 VMA9YCL005W-A 222 nt2.28□□□□□ -2.04
SNT2P53127 MDS3YGL197W 4464 nt2.28□□□□□ -2.04
SNT2P53127 NAN1YPL126W 2691 nt2.27□□□□□ -2.05
SNT2P53127 EFG1YGR271C-A 702 nt2.27□□□□□ -2.05
SNT2P53127 UTP13YLR222C 2454 nt2.27□□□□□ -2.05
SNT2P53127 YVC1YOR087W 2028 nt2.27□□□□□ -2.05
SNT2P53127 GNT1YOR320C 1476 nt2.27□□□□□ -2.05
SNT2P53127 UTP21YLR409C 2820 nt2.27□□□□□ -2.05
SNT2P53127 PAU2YEL049W 363 nt2.26□□□□□ -2.05
SNT2P53127 PAU12YGR294W 363 nt2.26□□□□□ -2.05
SNT2P53127 PAU18YLL064C 363 nt2.26□□□□□ -2.05
SNT2P53127 PAU6YNR076W 363 nt2.26□□□□□ -2.05
SNT2P53127 PAU24YBR301W 363 nt2.26□□□□□ -2.05
SNT2P53127 MDM10YAL010C 1482 nt2.26□□□□□ -2.05
SNT2P53127 MRPL49YJL096W 486 nt2.25□□□□□ -2.05
SNT2P53127 YBR090CYBR090C 369 nt2.25□□□□□ -2.05
SNT2P53127 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.25□□□□□ -2.05
SNT2P53127 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.25□□□□□ -2.05
SNT2P53127 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.25□□□□□ -2.05
SNT2P53127 RPN5YDL147W 1338 nt2.25□□□□□ -2.05
SNT2P53127 DXO1YDR370C 1329 nt2.25□□□□□ -2.05
SNT2P53127 HFM1YGL251C 3564 nt2.25□□□□□ -2.05
SNT2P53127 VHR1YIL056W 1923 nt2.25□□□□□ -2.05
SNT2P53127 TGL2YDR058C 981 nt2.25□□□□□ -2.05
SNT2P53127 YOR114WYOR114W 885 nt2.25□□□□□ -2.05
SNT2P53127 YOL057WYOL057W 2136 nt2.24□□□□□ -2.05
SNT2P53127 VPS35YJL154C 2835 nt2.24□□□□□ -2.05
SNT2P53127 YFH1YDL120W 525 nt2.24□□□□□ -2.05
SNT2P53127 SMT3YDR510W 306 nt2.24□□□□□ -2.05
SNT2P53127 COG2YGR120C 789 nt2.24□□□□□ -2.05
SNT2P53127 BNS1YGR230W 414 nt2.24□□□□□ -2.05
SNT2P53127 TRZ1YKR079C 2517 nt2.23□□□□□ -2.05
SNT2P53127 RPS29BYDL061C 171 nt2.23□□□□□ -2.05
SNT2P53127 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.23□□□□□ -2.05
SNT2P53127 CDA2YLR308W 939 nt2.23□□□□□ -2.05
SNT2P53127 YBL029WYBL029W 1131 nt2.23□□□□□ -2.05
SNT2P53127 PAC1YOR269W 1485 nt2.22□□□□□ -2.05
SNT2P53127 ALB1YJL122W 528 nt2.22□□□□□ -2.05
SNT2P53127 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.5 ms