Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP98P52948 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP98P52948 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP98P52948 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP98P52948 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP98P52948 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP98P52948 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP98P52948 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP98P52948 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP98P52948 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP98P52948 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP98P52948 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP98P52948 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP98P52948 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP98P52948 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP98P52948 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP98P52948 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP98P52948 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP98P52948 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP98P52948 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP98P52948 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP98P52948 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP98P52948 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP98P52948 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP98P52948 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP98P52948 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
NUP98P52948 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP98P52948 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP98P52948 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP98P52948 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP98P52948 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP98P52948 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP98P52948 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP98P52948 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP98P52948 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP98P52948 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP98P52948 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP98P52948 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP98P52948 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP98P52948 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP98P52948 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP98P52948 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP98P52948 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP98P52948 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP98P52948 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP98P52948 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP98P52948 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP98P52948 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP98P52948 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP98P52948 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP98P52948 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP98P52948 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP98P52948 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP98P52948 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP98P52948 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP98P52948 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP98P52948 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP98P52948 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP98P52948 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP98P52948 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP98P52948 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms