Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RND2P52198 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RND2P52198 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RND2P52198 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RND2P52198 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RND2P52198 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RND2P52198 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RND2P52198 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RND2P52198 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RND2P52198 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RND2P52198 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RND2P52198 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RND2P52198 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RND2P52198 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RND2P52198 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RND2P52198 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RND2P52198 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RND2P52198 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RND2P52198 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RND2P52198 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RND2P52198 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RND2P52198 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RND2P52198 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RND2P52198 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RND2P52198 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RND2P52198 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RND2P52198 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms