Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK4P51957 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK4P51957 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK4P51957 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK4P51957 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK4P51957 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK4P51957 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK4P51957 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK4P51957 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK4P51957 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEK4P51957 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEK4P51957 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEK4P51957 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK4P51957 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK4P51957 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK4P51957 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK4P51957 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK4P51957 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK4P51957 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK4P51957 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK4P51957 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK4P51957 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK4P51957 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK4P51957 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK4P51957 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK4P51957 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK4P51957 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK4P51957 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK4P51957 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK4P51957 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK4P51957 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK4P51957 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK4P51957 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK4P51957 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK4P51957 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK4P51957 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK4P51957 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK4P51957 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK4P51957 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK4P51957 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK4P51957 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK4P51957 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK4P51957 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK4P51957 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK4P51957 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK4P51957 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK4P51957 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK4P51957 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK4P51957 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK4P51957 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK4P51957 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK4P51957 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK4P51957 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK4P51957 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK4P51957 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK4P51957 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK4P51957 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms