Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms