Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTHFSP49914 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms