Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms