Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PXNP49023 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PXNP49023 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PXNP49023 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PXNP49023 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PXNP49023 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PXNP49023 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PXNP49023 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PXNP49023 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PXNP49023 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PXNP49023 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PXNP49023 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PXNP49023 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PXNP49023 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PXNP49023 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PXNP49023 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PXNP49023 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PXNP49023 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PXNP49023 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PXNP49023 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PXNP49023 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PXNP49023 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PXNP49023 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PXNP49023 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PXNP49023 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PXNP49023 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXNP49023 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXNP49023 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXNP49023 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXNP49023 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXNP49023 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXNP49023 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXNP49023 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXNP49023 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXNP49023 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXNP49023 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXNP49023 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXNP49023 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXNP49023 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXNP49023 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXNP49023 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXNP49023 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXNP49023 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXNP49023 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PXNP49023 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PXNP49023 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PXNP49023 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PXNP49023 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PXNP49023 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PXNP49023 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PXNP49023 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PXNP49023 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PXNP49023 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXNP49023 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXNP49023 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXNP49023 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXNP49023 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXNP49023 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXNP49023 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXNP49023 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PXNP49023 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXNP49023 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXNP49023 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXNP49023 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXNP49023 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXNP49023 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXNP49023 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXNP49023 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXNP49023 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXNP49023 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXNP49023 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXNP49023 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXNP49023 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PXNP49023 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PXNP49023 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PXNP49023 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PXNP49023 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PXNP49023 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms