Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms